Helsingin satamien kautta kulkee vuosittain lähes yhdeksän miljoonaa matkustajaa. Satamien toimintaa valvotaan tarkasti ja satamissa on tarkat turvamääräykset sekä matkustajaliikenteelle että tavaraliikenteelle. Poikkeavissa tilanteissa matkustajien turvallisuuden takaaminen on ensisijainen tehtävä.
 
Poikkeavia tilanteita satamissa voi olla monenlaisia. Tavallisin poikkeustilanne on kovan merenkäynnin aiheuttama pienempien pika-alusten vuoron peruuttaminen. Tällaisissa tilanteissa terminaaleissa on jatkuvasti saatavilla ajantasaista tietoa liikenteestä vastaavien varustamoiden kautta.
 
Onnettomuus- tai vaaratilanteissa pelastustoimista vastaavat pelastuslaitos ja poliisi. Sataman omat vartijat huolehtivat järjestyksen valvonnasta normaalitilanteissa ja osallistuvat pelastustehtäviin viranomaisten ohjauksessa.